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公司董事会设发展战略委员会，风险管理委员会，审计委员会和薪酬与提名委员会，四个专门委员会，公司经营层设风险控制，绩效考核，投资决策，项目内核四个非常设委员会，公司内设部门有营销经纪总部，投资银行总部投资管理总部，客户资产管理总部，北京业务总部，上海业务总部，南方业务总部，七大业务总部，及固定收益部资本运营部，投资研究中心，客户资，金存管中心，信息技术部，资金计划部，法律事务部，风险监管部，稽核部，董事会办公室人力资源部，办公室财务会计部，行政管理部等业务经营与综合管理部门，48家证券营业部，20家证券服务部，覆盖北京上海天津重庆深圳沈阳青岛大连广州无锡杭州中山等金融中心城市，及安徽省各地市，员工人数超过8000人，2004年9月，公司控股长盛基金管理有限公司，2005年10月，公司取得创新试点证券公司资格，2006年6月，公司获批在香港设立国元证券香港有限公司，2007年7月，公司获批注资控股国元期货经纪有限公司，2007年8月，在中国证监会组织的证券公司，分类评选中被评为A类A级证券公司，2007年10月，经中国证监会批准公司收购原天勤证券13家营业部，正式新设开业，2007年10月30日，公司在深圳证券交易所成功上市，股票代码000728。
公司自营投资业务建立了集中领导、科学决策、分级授权、权责明确、反馈及时自营投资管理体系。投资决策委员会、自营业务领导小组、投资业务部门构成了多层次、有机统一、
